Construída em mármore da Arrábida por Boytac em 1491, a Igreja de Jesus é considerada a primeira manifestação da arte manuelina. O seu portal flamejante e as suas três naves abobadadas com a mesma altura, que a tornam uma igreja salão, caracterizam o estilo gótico tardio. No interior, as paredes da nave e do coro estão em parte revestidas de azulejos do séc. XVII. No convento adjacente está instalado o Museu Municipal, cuja obra-prima é o retábulo do Mestre de Setúbal.