Este museu é dedicado à antropologia, à antiguidade e às culturas indígenas. Ocupa o prédio "Califórnia Building", famoso por sua torre sineira de 55 m de altura e seu carrilhão. No piso térreo encontram-se réplicas das estelas encontradas na cidade Maya de Quirigua, na Guatemala. No 1º andar, a exposição "Early man" apresenta um modelo do esqueleto de Lucy, ancestral bípede do homem. "Life and Death on the Nilo" apresenta objetos do antigo Egito (múmias e coleção de estatuetas funerárias). Outra seção expõe múmias peruanas, mexicanas e egípcias. A exposição « Life Cycles and Ceremonies » mostra uma visão geral dos rituais relacionados à puberdade, ao casamento, à união sexual e ao nascimento. Para descobrir o modo de vida e o artesanato dos Kumeyaay, tribo descoberta pelos missionários no final do século XVIII, não perca o « Kumeyaay: Native Californians » O Centro da Descoberta convida as crianças a explorar os mistérios do antigo Egito.