Refúgio do Khalifa localiza-se em Caraguatatuba, na região de São Paulo, nas proximidades de Praia do Indaiá e Teatro Mário Covas, e fornece acomodações com acesso Wi-Fi gratuito e estacionamento privado gratuito. Um frigorífico e chaleira também estão disponíveis. Terminal Rodoviário de Caraguatatuba fica a 2,4 km de Refúgio do Khalifa, enquanto Porto de São Sebastião fica a 26 km de distância. O Aeroporto Regional de São José dos Campos fica a 84 km da propriedade.