Refúgio São Rafael localiza-se em Cachoeira Paulista, apenas a 34 km de Terminal Rodoviário de Aparecida, e fornece acomodações com vista do jardim, acesso Wi-Fi gratuito e estacionamento privado gratuito. O alojamento está a 34 km de Igreja de São Benedito e 34 km de Basílica Velha. O alojamento dispõe de kitchenette. Santuário Nacional fica a 35 km de Refúgio São Rafael, enquanto Observatório da Nossa Senhora da Aparecida está a 36 km de distância. O Aeroporto Regional de São José dos Campos fica a 114 km da propriedade.